Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms