Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RNF7Q9UBF6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF7Q9UBF6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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