Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL9Q9P2J3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms