Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms