Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C11orf49Q9H6J7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms