Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CIPCQ9C0C6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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