Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms