Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms