Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms