Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms