Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms