Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBAC1Q9BSL1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms