Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms