Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms