Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3CQ99985 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEMA3CQ99985 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEMA3CQ99985 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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