Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP88Q99567 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms