Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms