Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHFRQ96EP1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms