Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms