Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC10Q969S8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms