Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF34Q969K3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms