Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP13Q92995 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP13Q92995 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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