Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXD4L4Q8WXT5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L4Q8WXT5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms