Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms