Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SFRP1Q8N474 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms