Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARP9Q8IXQ6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms