Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms