Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PADI4-201ENST00000375448 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms