Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms