Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms