Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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