Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms