Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms