Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms