Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTF1Q16619 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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