Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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