Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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NCOA1Q15788 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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