Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms