Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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