Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NWD1Q149M9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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