Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SSPNQ14714 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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