Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX1Q14549 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms