Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTTNQ14247 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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