Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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