Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms