Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms