Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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