Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHAF1BQ13112 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHAF1BQ13112 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CHAF1BQ13112 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms