Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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