Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms